MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Caldilinea aerophila DSM 14535 = NBRC 104270

Total Repeats: 12768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017079	CAA	2	6	1475	1480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017079	T	6	6	1507	1512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017079	GCCG	2	8	2713	2720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017079	TGGC	2	8	2787	2794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017079	CTGA	2	8	2845	2852	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017079	ACA	2	6	2868	2873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017079	CCTG	2	8	6833	6840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017079	CTC	2	6	6857	6862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017079	TTC	2	6	7858	7863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017079	T	7	7	7913	7919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017079	CCTG	2	8	7931	7938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017079	TTTG	2	8	7998	8005	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017079	TGT	2	6	8008	8013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017079	TCCA	2	8	8032	8039	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017079	A	6	6	8051	8056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017079	ATTCA	2	10	8101	8110	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017079	TCC	2	6	8625	8630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017079	CATT	2	8	13131	13138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017079	AAC	2	6	13155	13160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017079	TGAGA	2	10	13219	13228	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017079	CCGG	2	8	14436	14443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017079	TC	3	6	14487	14492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017079	CGATA	2	10	14495	14504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017079	CTG	2	6	14512	14517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017079	TGT	2	6	14523	14528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017079	ATCGTT	2	12	14530	14541	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017079	TCC	2	6	15947	15952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017079	A	6	6	16028	16033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017079	AGG	2	6	16077	16082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017079	AAG	2	6	17184	17189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017079	AATG	2	8	17200	17207	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017079	GGA	2	6	20034	20039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017079	AGC	2	6	21340	21345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017079	GTC	2	6	21463	21468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017079	CAGT	2	8	21874	21881	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017079	GC	3	6	24003	24008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017079	AG	4	8	24864	24871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017079	GAG	2	6	24874	24879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017079	GAG	2	6	24888	24893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017079	GCCA	2	8	25258	25265	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017079	GGC	2	6	25393	25398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017079	GCC	2	6	25407	25412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017079	CT	3	6	29003	29008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017079	CGC	2	6	29019	29024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017079	T	7	7	29029	29035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017079	GC	3	6	29881	29886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017079	TCC	2	6	31779	31784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017079	A	6	6	31815	31820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017079	TTGA	2	8	31899	31906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017079	TAC	2	6	31923	31928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017079	CAT	2	6	31947	31952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017079	CA	4	8	31954	31961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017079	ATTGA	2	10	31994	32003	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017079	GAA	2	6	32039	32044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017079	AAT	2	6	33628	33633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017079	GA	3	6	33656	33661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017079	CGG	2	6	33680	33685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017079	GATCC	2	10	33687	33696	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017079	AGCGA	2	10	33716	33725	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017079	AG	3	6	33726	33731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017079	GCCGAC	2	12	33791	33802	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017079	CAG	2	6	33829	33834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017079	CAG	2	6	33836	33841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017079	TGT	2	6	33906	33911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017079	TGG	2	6	34027	34032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017079	AC	3	6	34078	34083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017079	T	7	7	34146	34152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017079	AG	3	6	35017	35022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017079	CGAT	2	8	35031	35038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017079	AAG	2	6	35045	35050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017079	GAT	2	6	36132	36137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017079	AGGA	2	8	36140	36147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017079	GAG	2	6	38376	38381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017079	GTG	2	6	38407	38412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017079	CCA	2	6	38422	38427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017079	ATGAA	2	10	38543	38552	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017079	T	7	7	38651	38657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017079	GTCAG	2	10	38715	38724	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017079	ATCT	2	8	38949	38956	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017079	ACA	2	6	39053	39058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017079	CGA	2	6	39070	39075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017079	CG	3	6	39120	39125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017079	TCC	2	6	39225	39230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017079	CAT	2	6	42076	42081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017079	C	6	6	42098	42103	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_017079	A	6	6	42145	42150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017079	TTC	2	6	42188	42193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017079	AGG	2	6	42204	42209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017079	GGC	2	6	45863	45868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017079	GCG	2	6	45873	45878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017079	ATCG	2	8	46531	46538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017079	TC	3	6	48097	48102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017079	CT	3	6	48103	48108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017079	AAC	2	6	48187	48192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017079	CAT	2	6	49118	49123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017079	CGG	2	6	49127	49132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017079	AAC	2	6	49139	49144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017079	GAT	2	6	52892	52897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017079	A	6	6	52958	52963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017079	GCAA	2	8	54839	54846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017079	ATTGA	2	10	54849	54858	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017079	AAG	2	6	54861	54866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017079	CT	3	6	54880	54885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017079	A	7	7	54918	54924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017079	CTTG	2	8	55183	55190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017079	CAGC	2	8	55206	55213	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017079	TGG	2	6	55221	55226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017079	CAG	2	6	55281	55286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017079	CTT	2	6	55390	55395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017079	AGG	2	6	55432	55437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017079	GGA	2	6	58012	58017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017079	ATTG	2	8	58536	58543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017079	ATA	2	6	60582	60587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017079	GGC	2	6	60597	60602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017079	TCTCT	2	10	60625	60634	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017079	TCC	2	6	66757	66762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017079	CAT	2	6	66797	66802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017079	CT	3	6	66806	66811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017079	AGG	3	9	66844	66852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017079	T	7	7	71797	71803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017079	TGA	2	6	71836	71841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017079	A	7	7	71856	71862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017079	ACA	2	6	71927	71932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017079	TTC	2	6	71982	71987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017079	TCC	2	6	72608	72613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017079	CGCA	2	8	72636	72643	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017079	GAAGA	2	10	72695	72704	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017079	CCT	2	6	72711	72716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017079	AGGCA	2	10	72883	72892	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017079	TAT	2	6	72895	72900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017079	T	6	6	72939	72944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017079	AC	3	6	72952	72957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017079	GGAAA	2	10	72963	72972	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017079	AGA	2	6	73000	73005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017079	GAA	2	6	73021	73026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017079	GGA	2	6	73096	73101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017079	CT	3	6	73120	73125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017079	GTT	2	6	75721	75726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017079	ATGG	2	8	75728	75735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017079	CTT	2	6	78065	78070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017079	CAC	2	6	78109	78114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017079	ACC	2	6	78119	78124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_017079	AG	3	6	78133	78138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017079	AAG	2	6	78153	78158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017079	CT	3	6	78224	78229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017079	TG	3	6	78238	78243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017079	GTG	2	6	78248	78253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017079	TCT	2	6	78274	78279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017079	GTG	2	6	78292	78297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_017079	GATA	2	8	164515	164522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
281	NC_017079	TGCA	2	8	164525	164532	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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288	NC_017079	T	6	6	165386	165391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017079	TGTT	2	8	166983	166990	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_017079	TCAA	2	8	232752	232759	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
423	NC_017079	AAAG	2	8	232761	232768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
424	NC_017079	TGAC	2	8	233736	233743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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426	NC_017079	ACT	2	6	233789	233794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_017079	GGA	2	6	233805	233810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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